سید علی فرمانده ای قاطع و دلاور و عضو شورای فرماندهی سپاه بود.
بسیاری از یاران و همراهان وی در سپاه به فیض شهادت نائل شدند.
سیدعلی در اکثر عملیاتها به عنوان فرمانده حضور داشت و حماسه های زیادی آفرید.
سید علی از سرداران جنگ و از دوستان نزدیک سردار رشید اسلام، شهید حاج حسین خرازی بود.
سید علی در عملیاتهای فتح المبین، محرم، آزادسازی خرمشهر، شکست حصر آبادان و مرصاد، حضوری جدی و عملیاتی داشت.
او عموما به عنوان فرمانده عملیات در بخشهای مختلف عملیاتی شرکت می نمود و بارها تا مرز شهادت پیش رفت.
عملیات فتح المبین، سیدعلی از فرماندهان موثر این عملیات بود.
اقدامات مؤثر او سبب شد که هر 15 روز، کاروان عظیمی از کمکهای مردمی، عازم جبهههای جنوب و غرب کشور میگردید.
سید علی جنازه قطعه قطعه شده عزیزترین برادر و یار او در واحد اطلاعات و عملیات سپاه پاسداران و یاور او در مبارزات انقلاب اسلامی و همراه او در جنگ تحمیلی، شهید والامقام سیدعباس میرباقری، را بدست خود از جبهه عین خوش در عملیات محرم 1361 به خوانسار انتقال و در کنار سایر دوستان شهیدش به خاک سپرد.
مراسم باشکوه تشییع پیکر پاک شهید سیدعباس میرباقری